############################################################################## ############################################################################## ### ### Running command: ### ### /home/biocbuild/R/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data PhosR ### ############################################################################## ############################################################################## * checking for file ‘PhosR/DESCRIPTION’ ... OK * preparing ‘PhosR’: * checking DESCRIPTION meta-information ... OK * installing the package to build vignettes * creating vignettes ... ERROR --- re-building ‘PhosR.Rmd’ using rmarkdown Quitting from lines 489-498 [unnamed-chunk-39] (PhosR.Rmd) Error: processing vignette 'PhosR.Rmd' failed with diagnostics: there is no package called 'reactome.db' --- failed re-building ‘PhosR.Rmd’ SUMMARY: processing the following file failed: ‘PhosR.Rmd’ Error: Vignette re-building failed. Execution halted