See download stats for:    Bioconductor software packages    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages

Download stats for Bioconductor workflow packages

This page was generated on 2024-06-14 03:38:08 -0400 (Fri, 14 Jun 2024).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).

All workflow package stats in one file: workflows_pkg_stats.tab

All workflow package download scores in one file: workflows_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor workflow repository (all packages combined)

4.10.1 (1)
ABAData (1)
abc (1)
abind (1)
ace.fma (1)
acepack (2)
ACTIONet (1)
actuar (1)
ada (1)
AdaptGauss (1)
ade4 (4)
adegraphics (1)
adephylo (1)
aditools (1)
adjustedCurves (1)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (20)
adSplit (1)
afex (1)
affxparser (0)
affy (1)
affycoretools (1)
affyio (1)
AGHmatrix (1)
agricolae (1)
AICcmodavg (1)
aigoraFitMini (0)
airr (1)
akima (1)
alakazam (1)
ALDEx2 (1)
alembic (1)
AlgDesign (2)
alkahest.generic (1)
ALL (1)
almanac (1)
alphashape3d (0)
alphavantager (1)
altair (1)
amap (1)
AMARETTO (0)
Amelia (1)
amgen.okta.client (1)
amgsafetyvis (1)
amlogger (1)
ANCOMBC (1)
angrycell (1)
animation (2)
annaffy (1)
anndata (1)
annotate (2)
annotation (56)
AnnotationDbi (24)
AnnotationFilter (1)
AnnotationForge (1)
AnnotationHub (2)
annotatr (1)
anRichment (1)
anticlust (1)
AnVIL (0)
anytime (1)
aod (1)
apcluster (1)
APCtools (1)
ape (17)
apeglm (1)
apex (1)
apexcharter (1)
APL (1)
aplot (30)
appgen (1)
archive (1)
argparse (1)
argus.DS.Credentials (2)
argusDS.apc.utils (2)
argusDS.backtesting.engine (2)
argusDS.data (2)
argusDS.data.engineering (1)
argusDS.data.preparation (2)
argusDS.data.preparation2 (4)
argusDS.data.visualisation (1)
argusDS.database (1)
argusDS.DataValidation (1)
argusDS.DB.manager.utilities (2)
argusDS.distributions (1)
argusDS.driver.importance (2)
argusDS.FCUtilities (2)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.FZ.utils (1)
argusDS.gamboostLSS (1)
argusDS.gamlss.distributions (1)
argusDS.gamlss.forecast (2)
argusDS.gamlss.modelling (2)
argusDS.gamlss.smoothers (1)
argusDS.gamlss.testing (3)
argusDS.gamlss.utils (2)
argusDS.GlobalSettings (1)
argusDS.model.testing (1)
argusDS.model.tools (2)
argusDS.model.validation (1)
argusDS.modeldb (1)
argusDS.possibility.curves.daily (1)
argusDS.PossibilityCurves.db.utils (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (1)
argusDS.S3 (1)
argusDS.shiny.utils (2)
argusDS.signal.dataprep (1)
argusDS.smoothers (1)
argusDS.spread.trading.utils (2)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (2)
argusDS.Studio.permissions (2)
argusDS.Studio.utils (2)
argusDS.tabulator (1)
argusDS.trading.optimization (1)
argusDS.trading.performance (2)
argusDS.TradingSignals (1)
argusDS.UI (1)
argusDS.utilities (1)
aricode (1)
arm (1)
ArrayExpress (1)
arrayop (1)
arrays (34)
arrow (9)
arsenal (1)
arules (8)
ArvadosR (1)
arvupload (1)
ascii (1)
asciicast (1)
ash (1)
ashr (2)
AsioHeaders (5)
askpass (152)
assertive (1)
assertive.base (1)
assertive.code (1)
assertive.data (1)
assertive.data.uk (1)
assertive.data.us (1)
assertive.datetimes (1)
assertive.files (1)
assertive.numbers (1)
assertive.properties (11)
assertive.reflection (1)
assertive.strings (1)
assertive.types (11)
assertr (2)
assertthat (1)
astsa (1)
ATACseqQC (1)
ATE (1)
attachment (4)
AUCell (1)
audio (1)
audited (1)
av (1)
ava2 (1)
aws (1)
aws.s3 (1)
aws.signature (0)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (4)
AzureRMR (4)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
backbone (1)
backports (23)
badger (0)
bain (1)
bambu (1)
base2grob (1)
base64 (3)
base64enc (1)
base64url (1)
basemaps (1)
BASiCS (1)
basilisk (1)
basilisk.utils (0)
batchelor (1)
BatchJobs (1)
batchtools (0)
BayesFactor (2)
bayesm (9)
bayesplot (1)
BayesPostEst (1)
bayestestR (3)
baySeq (6)
BBmisc (1)
bbmle (4)
bbotk (1)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
bcp (1)
bdsmatrix (4)
beachmat (1)
beadarray (1)
beanplot (1)
beaver (1)
beeswarm (1)
bench (1)
benchmarkme (0)
berryFunctions (1)
bestglm (1)
bestNormalize (2)
betareg (1)
bettermc (1)
BgeeCall (2)
BgeeDB (1)
BGLR (1)
BH (133)
BIApylon (1)
BiasedUrn (2)
BIAutils (1)
bib2df (1)
bibtex (2)
biclust (1)
bigassertr (0)
bigD (0)
BIGL (1)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigreadr (0)
bigrquery (6)
billboarder (8)
bindrcpp (1)
binman (1)
binr (0)
bio3d (3)
biobank (1)
Biobase (8)
bioc::GenomeInfoDbData (0)
BiocBaseUtils (1)
BiocCheck (1)
BiocFileCache (4)
BiocFileCaches (1)
BiocGenerics (28)
BiocInstaller (1)
BiocIO (1)
BiocManager (176)
BiocMetaWorkflow (19)
biocmetaworkflow (1)
BiocNeighbors (2)
Bioconductor (1)
BiocParallel (11)
BiocSingular (1)
BiocStyle (1)
BiocVersion (33)
biocViews (1)
BioEnricher (1)
Biogenerics (1)
BioGenerics (1)
biomaRt (2)
biomartr (1)
biomformat (1)
biomod2 (1)
BioNet (1)
biostat3 (1)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostring (1)
Biostrings (6)
BioVersion (0)
biovizBase (1)
BiplotML (1)
bit (49)
bit64 (11)
bitops (12)
bizdays (2)
bkbutils (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blme (1)
blob (85)
blockcluster (1)
blockCV (1)
blockForest (1)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
bluster (1)
BMisc (1)
bmspal (0)
bnlearn (1)
bold (1)
bookdown (22)
Boom (1)
boomer (1)
BoomSpikeSlab (1)
boot (60)
box (10)
BP4RNAseq (18)
bp4rnaseq (1)
bRacatus (1)
brew (34)
brglm (1)
brglm2 (1)
BridgeDbR (1)
brio (73)
brms (1)
Brobdingnag (1)
broom (88)
broom.helpers (4)
broom.mixed (1)
broomExtra (1)
BrowserViz (1)
bs4Dash (10)
BSgenome (2)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (1)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (2)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major (1)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Oaries.ENSEMBL.RambV2 (1)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomes (1)
bsicons (2)
bslib (274)
bsplus (1)
bsseq (1)
bsts (1)
btergm (1)
bumphunter (1)
butcher (2)
BWStest (1)
C50 (1)
CAbiNet (1)
cachem (155)
CAGEWorkflow (19)
cageworkflow (1)
Cairo (24)
callr (114)
CAM (1)
CAMERA (1)
campsis (1)
campsismod (1)
candisc (1)
canvasXpress (1)
caper (1)
capsidr (1)
capushe (1)
car (27)
carData (2)
caret (22)
caretEnsemble (1)
castor (1)
CATALYST (0)
catboost (1)
Category (1)
caTools (5)
cba (1)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdrAlgorithm (1)
ccDSM (0)
cdip.datastore (1)
celda (1)
celldex (1)
cellpypes (1)
cellranger (1)
cellxgene.census (1)
cem (1)
censored (1)
CeTF (1)
cgdsr (1)
ChAMP (1)
changepoint (0)
chanmetab (1)
checkmate (149)
checkr (1)
ChemmineOB (1)
ChemmineR (1)
chemometrics (1)
chimeraviz (1)
ChIPpeakAnno (1)
ChIPseeker (1)
chipseqDB (22)
chipseqdb (1)
chk (3)
choroplethr (1)
chromote (7)
chromVAR (1)
chron (3)
cicero (1)
circlesize (0)
circlize (33)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (65)
classInt (30)
cli (222)
CLIFF (1)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clipr (9)
cliqueMS (1)
clock (21)
clue (37)
cluster (83)
clusterCrit (1)
clusterGeneration (3)
clustermq (4)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (3)
ClusterR (1)
clusterSim (1)
clustMixType (1)
clustree (2)
clValid (1)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
CNEr (1)
coastr (1)
cobalt (2)
coda (10)
coda.base (1)
codetools (74)
coin (1)
collapse (1)
collections (0)
colorRamps (3)
colorspace (58)
colortools (1)
colourpicker (9)
colourvalues (1)
cols4all (1)
common (1)
commonmark (118)
compareDF (1)
compareGroups (1)
ComplexHeatmap (2)
complexheatmap (0)
ComplexUpset (1)
compositions (3)
condiments (1)
config (15)
confintr (1)
conflicted (2)
confoundr (1)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consensusClustR (1)
consort (1)
contentid (1)
contingencytables (1)
CoordinateCleaner (1)
copula (2)
CoRegNet (1)
coro (1)
corpcor (2)
corpora (1)
correlation (1)
corrplot (2)
corrr (1)
COSG (1)
cosmosR (1)
countrycode (12)
coveffectsplot (1)
covr (25)
covRNA (0)
cowplot (62)
coxphf (1)
CoxPhLb (1)
coxphw (1)
cplm (1)
cpp11 (202)
cqn (0)
crayon (75)
credentials (24)
crew (3)
crew.cluster (1)
CRISPR.shinyapp (1)
crossmatch (1)
crosstable (1)
crosstalk (104)
crul (21)
csawUsersGuide (18)
csawusersguide (1)
csv (0)
cubature (1)
cubelyr (0)
Cubist (1)
curatedMetagenomicData (0)
curl (350)
cvAUC (1)
cvms (1)
CVST (0)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cyclocomp (12)
cydar (1)
cyphr (1)
cytofkit (0)
cytofWorkflow (72)
cytofworkflow (1)
cytolib (1)
CytoML (1)
CytoTRACE (1)
CytoTree (1)
D2C (1)
d3heatmap (1)
d3r (1)
d3treeR (1)
dada2 (0)
daff (1)
dagitty (1)
DAISIE (1)
DALEX (1)
DALEX2 (1)
DAMEfinder (1)
dapr (1)
dasnormalize.iomel (1)
dastools (1)
data.table (198)
data.tree (12)
DatabaseConnector (1)
dataCompareR (1)
DataExplorer (1)
dataframes2xls (1)
datamods (7)
DataOmnio (1)
datapasta (1)
datasauRus (1)
DataVisualizations (1)
datawizard (5)
date (1)
dbaccess (1)
dbarts (2)
DBI (178)
DBItest (0)
dblplyr (1)
dbplyr (157)
dbscan (5)
dbx (8)
dcat (1)
dcdatr (1)
ddalpha (0)
DDCompanion (1)
debugme (0)
DECIPHER (1)
deconfectHelpers (1)
deconstructSigs (1)
decor (1)
decoupleR (1)
decoupler (1)
deepregression (1)
deeptime (1)
Delaporte (1)
DelayedArray (4)
DelayedMatrixStats (2)
deldir (49)
demuxmix (1)
dendextend (35)
densEstBayes (1)
densityClust (1)
densvis (1)
DEoptim (0)
DEoptimR (17)
DEP (1)
desc (103)
descr (1)
DescTools (18)
DESeq (0)
DESeq2 (3)
designmatch (1)
DEsingle (1)
deSolve (23)
devEMF (1)
devtools (10)
devutils (1)
DEXSeq (1)
dfidx (0)
dfoptim (1)
DHARMa (0)
DiagrammeR (4)
dials (2)
DiceDesign (2)
diceR (1)
dichromat (6)
did (1)
DiffBind (1)
diffloop (1)
diffobj (10)
digest (281)
dimRed (0)
Dino (1)
diptest (2)
dir.expiry (0)
directlabels (1)
DirichletMultinomial (1)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distory (1)
distr (1)
distr6 (1)
distributional (3)
DistributionUtils (2)
dittodb (1)
dittoSeq (0)
DiurnalMRI (1)
dlm (1)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMRcate (0)
DMwR (1)
DNABarcodes (1)
DNAcopy (0)
dnet (1)
DO.db (1)
doBy (1)
dockerfiler (1)
DoE.base (1)
doFuture (1)
doMC (2)
doParallel (6)
doRNG (4)
dorothea (1)
DOSE (2)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doseR (1)
doSNOW (1)
dotCall64 (8)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
downlit (18)
downloadthis (1)
dparser (0)
dplyr (244)
dplyrb (1)
dpplyr (1)
dqrng (31)
drake (9)
drat (1)
drc (1)
DRDID (1)
dreamerr (1)
DropletUtils (2)
DRR (0)
dspNgs (0)
DT (186)
dtplyr (33)
dttr2 (1)
dtw (1)
dtwclust (1)
duckdb (3)
duct.tape (1)
dunn.test (0)
dynfeature (1)
dynplot (1)
dynwrap (1)
e1071 (49)
earth (2)
easyalluvial (1)
easyENTIM (1)
easystats (1)
ebal (1)
EBImage (1)
ecfc (1)
echarts4r (11)
ecodist (1)
ECOSolveR (1)
ecospat (1)
Ecume (0)
edgeR (2)
effectsize (3)
EGSEA123 (16)
egsea123 (1)
eha (1)
elasticsearchr (1)
elevatr (2)
ellipse (33)
ellipsis (14)
ELMER (1)
ELMER.data (1)
emayili (2)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (1)
emdist (1)
emmeans (73)
energy (1)
engitix.singlecell.db (1)
engitomixmk2 (0)
english (1)
EnhancedVolcano (1)
enmSdmX (1)
ENMTools (1)
enrichplot (2)
enrichPlot (1)
enrichR (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (1)
ensembldb (1)
entropy (2)
envalysis (1)
EnvStats (1)
Epi (1)
epiR (3)
EpiStats (1)
eQTL (4)
ergm (0)
errorlocate (1)
escape (0)
esquisse (3)
estimability (10)
eulerr (1)
europepmc (1)
evaluate (290)
EValue (2)
evd (1)
ewfutils (1)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactextractr (1)
exactRankTests (2)
ExperimentHub (1)
ExpHunterSuite (17)
exphuntersuite (1)
explore (1)
ExploreModelMatrix (0)
ExplorOMICS (1)
expm (19)
ExpressionNormalizationWorkflow (29)
expressionnormalizationworkflow (1)
expss (6)
extraChIPs (1)
extraDistr (1)
extrafont (3)
extrafontdb (1)
fable (1)
fabletools (1)
factoextra (1)
FactoMineR (29)
fairhub.metadata (0)
fairhub.r.client (1)
fakepackage (1)
fansi (229)
farver (56)
fastcluster (6)
fastDummies (23)
fasterize (1)
fastGHQuad (1)
fastICA (2)
fastmap (88)
fastmatch (27)
fastmatrix (1)
fastqcr (1)
fastshap (1)
faux (1)
fauxpas (0)
fBasics (2)
FD (1)
fda (2)
fdrtool (3)
feasts (1)
feather (1)
fenr (1)
fExtremes (4)
ff (3)
fftw (1)
fftwtools (1)
fGarch (3)
fgsea (1)
fido (1)
fields (5)
filehash (0)
filelock (53)
filesstrings (1)
finalfit (1)
findpython (1)
finetune (1)
fit.models (1)
fitdistrplus (21)
fixest (1)
flair (1)
flexclust (0)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flextable (13)
float (1)
flowAI (0)
flowClust (1)
FlowCore (1)
flowCore (1)
flower (1)
flowWorkspace (0)
flowWorkspaceData (0)
fluentGenomics (18)
fluentgenomics (1)
flux (1)
FME (1)
fmsb (1)
fmtr (1)
FNN (77)
foghorn (1)
fontawesome (98)
forcats (12)
foreach (8)
forecast (5)
foreign (53)
forestplot (1)
forestploter (1)
fork (1)
formatR (53)
formatters (3)
Formula (14)
forrester.metadata (0)
fpc (9)
fracdiff (3)
FragPipeAnalystR (1)
FRASER (1)
freetypeharfbuzz (1)
fresh (1)
FrF2 (1)
frictionless (0)
fs (171)
FSA (1)
fst (1)
fstcore (1)
fUnitRoots (1)
funkyheatmap (1)
furrr (9)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (139)
future.apply (118)
future.batchtools (1)
future.callr (4)
fuzzySim (1)
g3viz (1)
GA (39)
gam (2)
GAMBLR.results (1)
GAMBoost (1)
gamboostLSS (2)
gameofthrones (1)
gamlss (3)
gamlss.add (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (3)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapminder (1)
gargle (69)
gaston (1)
GastrographPackage (1)
gausscov (1)
gbm (43)
gbRd (1)
gcrma (0)
gdata (9)
gdsfmt (1)
gdsx (1)
gdtools (39)
gee (1)
geeasy (1)
geepack (5)
genefilter (2)
genefu (0)
geneplotter (1)
GeneralizedHyperbolic (1)
generegulation (22)
generics (38)
GenomeInfoDb (11)
GenomeInfoDbData (4)
GenomicAlignments (2)
GenomicFeatures (2)
GenomicRanges (3)
GenomicTools (1)
GenSA (2)
geobr (1)
geodata (1)
geodiv (1)
geohashTools (1)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonlint (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (1)
geometries (18)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (0)
GeoMxWorkflows (179)
geomxworkflows (1)
GEOquery (1)
geosphere (1)
GeoTcgaData (1)
gert (44)
gestalt (7)
getip (1)
getopt (4)
GetoptLong (3)
getPass (2)
gettz (0)
gfonts (1)
ggalluvial (1)
GGally (17)
ggalt (1)
gganimate (1)
ggbeeswarm (17)
ggbio (1)
ggbreak (1)
ggchicklet (1)
ggcorrplot (2)
ggdag (1)
ggdendro (6)
ggdensity (1)
ggdist (3)
ggeasy (1)
ggedit (1)
ggeffects (2)
ggExtra (5)
ggfittext (2)
ggforce (25)
ggformula (30)
ggfortify (2)
ggfun (37)
gggenes (1)
ggh4x (3)
gghalves (0)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (1)
ggiraph (4)
ggm (1)
ggmap (19)
ggmosaic (1)
ggmsa (1)
ggnetwork (1)
ggnewscale (29)
ggnewscales (1)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (280)
ggplotify (23)
ggpmisc (5)
ggPMX (1)
ggpp (6)
ggprism (1)
ggpubr (12)
ggRandomForests (0)
ggrap2 (1)
ggraph (18)
ggrastr (7)
ggrepel (185)
ggridges (35)
ggsci (38)
ggseqlogo (1)
ggside (4)
ggsignif (10)
ggspatial (1)
ggstance (1)
ggstats (2)
ggstatsplot (2)
ggsurvfit (1)
ggtern (14)
ggtext (2)
ggthemes (5)
ggtree (3)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (2)
ggwordcloud (1)
gh (34)
ghpm (1)
gifski (1)
git2r (7)
gitcreds (9)
gitlabr (1)
gittargets (1)
GLAD (1)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1)
glmGamPoi (1)
glmGamPoiR (1)
glmmADMB (0)
glmmTMB (2)
glmnet (12)
glmnetUtils (1)
glmperm (1)
GlobalOptions (1)
globals (38)
glue (116)
gmailr (1)
GMD (0)
Gmisc (1)
gmm (2)
gmodels (2)
gmp (5)
gmthemes (1)
gnm (1)
GO.db (3)
godmode (1)
goftest (13)
golem (6)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (52)
googlesheets (1)
googlesheets4 (59)
googleVis (2)
GOSemSim (1)
goshawk (1)
GOstats (1)
gower (4)
GPArotation (20)
gplots (70)
gprofiler2 (2)
gRain (1)
gralarkivar (1)
graph (1)
GraphGallery (1)
graphlayouts (45)
graphql (1)
gRbase (1)
greekLetters (1)
greybox (1)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (1)
grImport (1)
grImport2 (1)
groupdata2 (1)
gsDesign (1)
GSEABase (1)
GSEAbase (1)
gsl (3)
gson (2)
gss (3)
GSVA (1)
GSVAdata (1)
gt (10)
gtable (172)
gtExtras (1)
gtools (51)
gtsummary (3)
gubraqsar (1)
GUniFrac (2)
gupio (1)
Gviz (1)
gwasrapidd (1)
GWENA (1)
gWidgets (1)
gWidgets2tcltk (0)
gWidgetstcltk (1)
h2o (4)
HandTill2001 (1)
hardhat (38)
HardyWeinberg (1)
harmony (8)
hash (3)
haven (90)
hdf5 (1)
HDF5Array (2)
hdf5r (8)
HDInterval (1)
hdnom (1)
HDO.db (1)
heatmap.plus (1)
heatmaply (10)
heemod (1)
heplots (1)
here (1)
Herper (0)
hexbin (5)
HGNChelper (1)
hgu133a.db (1)
hgu133plus2.db (1)
hgu95a.db (1)
hgu95av2.db (1)
HiClimR (1)
highlight (0)
highr (36)
highthroughputassays (23)
HiTME (0)
Hmisc (33)
hms (73)
hoardr (1)
Homo.sapiens (0)
Hoover (1)
HPC.R.Utilities (1)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
hsm (0)
htmlTable (27)
htmltools (275)
htmlwidgets (181)
HTqPCR (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (9)
httptest2 (1)
httput (1)
httpuv (254)
httr (186)
httr2 (67)
hugene10sttranscriptcluster.db (1)
hunspell (5)
huxtable (2)
hwriter (3)
hydroPSO (1)
IAPWS95 (1)
iatlas.app (1)
iatlasGraphQLClient (1)
iBreakDown (1)
ica (15)
ICS (1)
ICSNP (1)
idorsiaQC (1)
IDPmisc (3)
idr (0)
ids (1)
igraph (156)
igvShiny (1)
iheatmapr (5)
IHW (1)
ijtiff (1)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (0)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (1)
imager (2)
imcRtools (0)
iml (1)
immunarch (1)
import (3)
ImpulseDE2 (1)
impute (1)
imputeLCMD (1)
imputeTS (1)
IncidencePrevalence (1)
iNEXT (1)
infer (3)
influenceR (2)
InformationValue (1)
infotheo (2)
ingredients (1)
ini (0)
InkblotAnalytics (14)
INLA (0)
inline (1)
inlinedocs (1)
InraeThemes (1)
insight (8)
installr (1)
intamap (1)
interactiveDisplayBase (1)
interactomes (1)
intergraph (1)
interp (15)
intervals (1)
inum (3)
ipaddress (1)
ipred (22)
ips (1)
iptmnetr (1)
ipw (1)
iq (1)
IRanges (11)
IRdisplay (1)
IRkernel (0)
irlba (22)
irr (1)
isoband (55)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (0)
IsoCorrectoRGUI (1)
iterators (8)
ITKR (1)
JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (3)
janitor (3)
JBrowseR (1)
jcolors (1)
JM (0)
JMbayes (1)
jnjtemplates (1)
job (1)
joineRML (0)
jomo (0)
jose (1)
jpeg (13)
jqr (9)
jquerylib (1)
jskm (1)
jsonify (1)
jsonlite (248)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (0)
JuliaCall (0)
kableExtra (10)
karyoploteR (1)
KEGG.db (1)
KEGGgraph (0)
KEGGREST (10)
keggsvg (1)
keras (8)
kernlab (5)
KernSmooth (74)
keyring (6)
khroma (1)
kinship2 (1)
klaR (3)
km.ci (2)
kmed (1)
knitr (245)
kohonen (2)
ks (7)
kSamples (1)
kutils (1)
L1pack (1)
l2p (1)
labeling (148)
labelled (7)
laeken (2)
Lahman (0)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (2)
lamW (3)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
lares (1)
lasso2 (1)
lastdose (1)
later (162)
latex2exp (1)
lattice (177)
latticeExtra (11)
lava (35)
lavaan (19)
lazyeval (1)
lbaQcCheck (1)
LBE (1)
lbfgs (0)
lbfgsb3c (1)
lda (0)
ldap (1)
LDlinkR (1)
LDplots (1)
leafem (1)
leaflegend (1)
leaflet (4)
leaflet.providers (2)
leaps (1)
learnr (6)
leiden (25)
leidenAlg (1)
leidenbase (8)
lemon (2)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (1)
liana (0)
libcoin (3)
LiblineaR (1)
libr (1)
lifecycle (198)
liftOver (243)
liftover (1)
lightgbm (1)
limma (75)
limmia (1)
limSolve (1)
LinMod2 (1)
linprog (1)
lintr (40)
listenv (46)
listviewer (1)
littler (1)
lm.beta (0)
lme4 (118)
lmerTest (1)
lmom (13)
lmomco (1)
lmtest (16)
lobstr (2)
locfit (81)
log4r (1)
logger (7)
LogicReg (1)
logistf (1)
logitnorm (1)
logr (1)
logrrr (1)
lokern (1)
LOLA (0)
loo (1)
LoomExperiment (1)
lotri (0)
LowRankQP (1)
lpSolve (15)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1)
lsa (1)
lsei (1)
lubridate (77)
Luminescence (1)
lvec (1)
lwgeom (2)
m03modeldevelopment (1)
M3Drop (1)
maboost (1)
MACSr (0)
maditr (1)
madness (1)
maEndToEnd (53)
MafDb.gnomAD.r2.1.hs37d5 (1)
maftools (1)
magic (1)
magicaxis (1)
magick (15)
magrittr (21)
maketools (13)
MALDIquant (3)
manipulateWidget (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mapplots (1)
mapproj (1)
maps (11)
maptools (8)
mapview (1)
marginaleffects (1)
margins (1)
Markdown (0)
markdown (57)
markovchain (1)
MASS (238)
MassSpecWavelet (1)
MAST (1)
Matching (2)
MatchIt (2)
MatchThem (1)
mathjaxr (1)
Matrix (328)
Matrix.utils (7)
matrixcalc (1)
MatrixExtra (1)
MatrixGenerics (2)
MatrixModels (97)
matrixStats (196)
matrixTests (1)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBESS (1)
mboost (2)
mc2d (1)
mclogit (0)
mclust (15)
mcmc (2)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (2)
MCPcounter (0)
mcr (8)
mctq (1)
mda (1)
memisc (0)
memoise (16)
memuse (1)
MendelianRandomization (1)
MESS (1)
metabaser (1)
MetaboAnalystR (1)
metabolomics (1)
MetaboReport (1)
metafor (4)
metaMA (2)
metap (2)
metapod (1)
methylationArrayAnalysis (121)
methylationarrayanalysis (1)
methylclock (1)
methylclockData (1)
metR (1)
metrumrg (1)
mets (1)
mFilter (1)
mgcv (251)
mgm (1)
mia (1)
mice (4)
miceadds (1)
microbenchmark (1)
microbiome (1)
microeco (1)
microseq (1)
miloR (1)
mime (24)
mimosa (1)
miniUI (1)
minpack.lm (3)
minqa (82)
mirai (2)
mirt (18)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (2)
missRanger (1)
misty (1)
mitml (0)
mix (0)
mixOmics (1)
mixsqp (2)
mixtools (1)
mixture (1)
MKmisc (1)
mlbench (1)
mlfa (1)
mlflow (1)
MLmetrics (1)
mlpack (1)
mlr (1)
mlr3 (2)
mlr3fselect (1)
mlr3learners (1)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (1)
mlr3spatiotempcv (1)
mlr3tuning (1)
mlr3tuningspaces (1)
mlr3viz (1)
mma (1)
mmrm (39)
mnormt (4)
MNP (0)
mockery (3)
mockr (0)
modelbased (1)
modeldata (3)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (34)
modelsummary (1)
modeltime.ensemble (1)
modeltools (0)
modEvA (1)
MODIStsp (2)
modules (5)
MOFA (1)
MOFA2 (1)
moleculaR (1)
moments (2)
Momocs (1)
monaLisa (1)
monkey (1)
monocle (1)
monocle3 (1)
MonoPhy (1)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaic (1)
mosaicCore (30)
mosaicData (1)
motifmatchr (1)
mousecortexref.SeuratData (1)
MPA (1)
mpm (1)
mpn.scorecard (1)
MPV (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msatR (1)
MsCoreUtils (1)
msdata (1)
MsFeatures (0)
msigdb (1)
msigdbr (1)
msm (6)
MSnbase (1)
MSstats (1)
MSstatsTMT (1)
MSstatsTMTs (0)
multcomp (48)
multcompView (25)
MultiAssayExperiment (1)
multicool (6)
multicross (1)
multiGSEA (0)
multinma (1)
multipanelfigure (2)
multtest (1)
MuMIn (1)
munsell (37)
muscat (1)
MutationalPatterns (0)
mutoss (2)
mvnfast (0)
mvtnorm (112)
myphd (0)
mzR (1)
n1qn1 (0)
NACHO (1)
namer (1)
naniar (1)
nanoarrow (1)
nanonext (2)
nanopipeline (1)
NanoPyx (1)
NanoStringDiff (0)
NanoStringNCTools (0)
NanoStringNorm (1)
nanostringr (1)
nanotime (1)
narray (0)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
ncappc (1)
ncar (1)
ncdf4 (11)
ncdfFlow (1)
NCmisc (2)
ncvreg (1)
ndjson (0)
Nebulosa (1)
neo2R (1)
NEONiso (1)
neonUtilities (1)
nephro (1)
nestcolor (1)
nestedcv (1)
NetBID2 (1)
netmeta (1)
network (2)
networkDynamic (1)
ngsReports (0)
nhanesA (1)
nleqslv (1)
nlme (190)
nlmeODE (1)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (0)
nlmixr2plot (1)
nloptr (25)
nls2 (1)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (4)
NMproject (1)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (66)
NNLM (1)
nnls (4)
nominatimlite (0)
NonCompart (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (2)
norm (2)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (1)
NORMT3 (1)
notame (1)
npde (1)
npsurv (1)
numbers (1)
numDeriv (1)
oce (1)
odbc (22)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (12)
oligo (0)
oligoClasses (0)
OlinkAnalyze (1)
olsrr (1)
omicsbase (0)
omnibus (1)
OmnipathR (1)
ompr (1)
ompr.roi (1)
oncomarkerbase (1)
ontologyIndex (2)
ontologyPlot (1)
oompaBase (1)
openeo (1)
OpenMx (1)
openssl (292)
openxlsx (15)
optimr (1)
optimx (14)
optmatch (2)
optparse (9)
optweight (1)
orca (1)
OrderedList (0)
ordinal (2)
ore (1)
org.At.tair.db (1)
org.Dm.eg.db (0)
org.Dr.eg.db (1)
org.Hs.eg.db (4)
org.Hs.eg.dB (0)
org.Mm.eg.db (2)
org.Pf.plasmo.db (1)
org.Psativumv2.eg.db (0)
org.Rn.eg.db (0)
org.Ss.eg.db (0)
OrganismDbi (1)
oricvis (1)
orientlib (0)
orthogene (1)
osmdata (18)
osprey (1)
osqp (2)
outliers (1)
packcircles (1)
packrat (41)
padr (1)
pagedown (1)
PAIRADISE (1)
pak (2)
paletteer (6)
palmerpenguins (1)
palr (1)
pals (2)
pammtools (1)
pamr (1)
pan (1)
pander (3)
pandoc (1)
panelr (1)
paquet (1)
paradox (1)
parallelly (122)
param6 (1)
parameters (5)
ParamHelpers (0)
parcats (1)
parsedate (3)
parsnip (4)
partitions (0)
party (9)
partykit (3)
patch (1)
patchwork (65)
pathfindR (1)
pathfindR.data (1)
pathview (1)
patientProfilesVis (1)
paws (9)
paws.analytics (9)
paws.application.integration (9)
paws.common (54)
paws.compute (11)
paws.cost.management (9)
paws.customer.engagement (9)
paws.database (9)
paws.developer.tools (3)
paws.end.user.computing (3)
paws.machine.learning (9)
paws.management (9)
paws.networking (9)
paws.security.identity (9)
paws.storage (51)
pbapply (46)
pbdZMQ (2)
pbkrest (0)
pbkrtest (34)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (1)
pbv (1)
pcaExplorer (0)
pcalg (1)
pcaMethods (1)
pcaPP (6)
PCAtools (1)
pdftools (9)
pdInfoBuilder (0)
pdist (0)
PeacoQC (0)
pec (1)
pedtools (1)
pegas (1)
PEIP (1)
PEMM (1)
Peptides (1)
performance (5)
PerformanceAnalytics (0)
periscope (1)
permute (3)
PFAM.db (1)
PFIM (1)
phangorn (2)
pharmaversesdtm (1)
pheatmap (1)
philentropy (2)
phonTools (1)
phosphoricons (5)
PhosR (0)
phyclust (1)
phylobase (1)
phyloseq (1)
phylosignal (1)
phytools (5)
picante (1)
piggyback (1)
pillar (103)
pinfsc50 (1)
pingr (11)
pins (34)
pipebind (1)
piton (1)
pixmap (3)
PK (1)
pkbrtest (1)
pkgbuild (77)
pkgcache (10)
pkgconfig (2)
pkgdepends (11)
pkgdown (25)
pkgKitten (1)
pkgload (205)
pkgmaker (2)
pkgpub (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (0)
PKPDdatasets (1)
PKPDmodels (1)
PKreport (1)
plantecophys (1)
plm (1)
PLNmodels (1)
plogr (1)
plot3D (3)
plotfunctions (1)
plotgardener (0)
plotly (152)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (12)
plotROC (1)
pls (3)
plumber (12)
plyr (136)
plyranges (1)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (0)
png (42)
poibin (1)
poilog (1)
pointblank (1)
PoissonBinomial (1)
polars (1)
poLCA (1)
polspline (3)
polyclip (80)
polycor (1)
polynom (3)
pool (6)
poolfstat (1)
poorman (2)
poppr (1)
PossibilityCurves (2)
posterior (1)
PowerExplorer (1)
poweRlaw (2)
PowerTOST (1)
prabclus (2)
pracma (18)
prada (1)
praise (1)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
PreciseSums (0)
precommit (1)
prediction (1)
preproc.iquizoo (1)
preprocessCore (1)
preprocessorCore (1)
presser (1)
presto (1)
prettydoc (1)
prettymapr (1)
prettyunits (146)
primeviewcdf (1)
primeviewprobe (1)
prioritylasso (1)
prismatic (2)
PRISMselector (1)
pROC (44)
processCore (0)
processx (205)
procs (1)
prodlim (35)
proffer (1)
profile (0)
profileModel (1)
profvis (9)
ProgMan (1)
progress (86)
progressr (48)
PROJ (5)
proj4 (20)
projpred (1)
promise (1)
promises (124)
prompt (1)
prompter (1)
propr (1)
ProSpect (0)
proteomics (5)
ProtGenerics (1)
protoarrayr (1)
protolite (1)
protr (1)
protti (1)
protViz (1)
proxy (2)
proxyC (2)
pryr (2)
ps (197)
pscl (2)
pspearman (1)
pspline (1)
psych (71)
psychometric (6)
psychTools (1)
ptw (1)
Publish (1)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (1)
PupillometryR (1)
purrr (139)
purrrr (1)
pvca (1)
qap (4)
qclMatrix (1)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
qgraph (2)
qicharts (1)
qlcMatrix (4)
qpdf (2)
qqconf (1)
qqman (3)
qqplotr (0)
qrcode (1)
qrnn (1)
qs (10)
qtl (1)
qtl2 (1)
quadprog (2)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantmod (11)
quantreg (55)
quarto (6)
questionr (2)
QuickJSR (1)
qvalue (1)
qvcalc (1)
qwraps2 (1)
r (1)
R.cache (2)
R.devices (1)
R.methodsS3 (14)
R.oo (48)
R.rsp (1)
R.utils (108)
R2admb (1)
r2d3 (1)
R2GUESS (1)
R2jags (1)
r2rtf (1)
R6 (16)
rAccess (2)
radiant (1)
radiant.data (1)
radiant.model (1)
ragg (126)
rainbow (1)
rAmCharts (1)
randomcoloR (1)
randomForest (3)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randtoolbox (1)
rangeModelMetadata (1)
ranger (13)
RankAggreg (1)
RApiDatetime (1)
RApiSerialize (7)
rappdirs (8)
rapportools (1)
raster (38)
rasterVis (1)
rayimage (1)
rayrender (1)
rayvertex (1)
RBesT (1)
RBGL (1)
rbibutils (46)
rbioapi (3)
rBLAST (1)
rbokeh (1)
Rcapture (1)
rcartocolor (0)
Rcgmin (1)
Rchoice (0)
RCircos (0)
RClickhouse (1)
rclipboard (5)
rcmdcheck (3)
Rcmdr (1)
RcmdrMisc (2)
RColorBrewer (15)
rcompanion (1)
Rcpp (255)
rcpp (1)
RcppAlgos (1)
RcppAnnoy (36)
RcppArmadillo (217)
RcppCCTZ (1)
RcppDate (1)
RcppDE (0)
RcppEigen (137)
RcppGSL (4)
RcppHNSW (31)
RcppInt64 (1)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (7)
RcppProgress (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (2)
RcppTOML (17)
Rcsdp (0)
RCurl (166)
RCy3 (1)
Rd2roxygen (0)
RDCOMClient (1)
rdflib (1)
Rdpack (47)
reactable (3)
reactlog (0)
reactome.db (1)
ReactomeGSA (0)
ReactomePA (1)
reactR (13)
readJDX (1)
readODS (1)
readr (82)
readstata13 (1)
readxl (81)
rearrr (1)
REBayes (1)
recipes (48)
reclin (1)
recommenderlab (7)
recosystem (7)
recountWorkflow (21)
recountworkflow (1)
reda (0)
REddyProc (1)
redison (1)
redland (1)
redux (1)
refinr (1)
RefManageR (1)
reghelper (1)
registry (1)
regress (1)
relations (1)
reldist (1)
relsurv (1)
remaCor (1)
rematch (75)
rematch2 (1)
remotes (65)
renderthis (1)
rentrez (1)
renv (150)
Repitools (1)
report (1)
reporter (1)
reporting (1)
ReportingTools (1)
repr (2)
reprex (35)
repurrrsive (0)
reshape (3)
reshape2 (3)
ResidualMatrix (1)
ResourceSelection (1)
restfulr (10)
RestRserve (7)
reticulate (56)
revealgenomics (2)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (8)
Rfast (7)
Rfast2 (2)
Rfit (1)
RFOC (1)
rgbif (1)
RGCCA (0)
rgdal (18)
rgenoud (1)
rgeos (17)
rgexf (1)
rgl (4)
Rglpk (1)
rglwidget (1)
rgnparser (1)
RgoogleMaps (7)
rgr (1)
Rgraphviz (0)
rhandsontable (2)
rhdf5 (2)
rhdf5filters (2)
Rhdf5lib (3)
rhino (7)
RhpcBLASctl (8)
Rhtslib (1)
rhub (3)
rice (1)
ridigbio (2)
riem (1)
Ringo (1)
rintrojs (7)
rio (9)
RIPSeeker (1)
RISCA (1)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
ritis (1)
RItools (1)
riverplot (1)
rjags (1)
rJava (43)
RJDBC (1)
rjson (8)
rjsoncons (1)
RJSONIO (17)
rlang (338)
rlecuyer (1)
rlemon (0)
rliger (1)
rlist (1)
rlistings (1)
Rmagic (1)
rmapshaper (1)
RMariaDB (8)
rmarkdown (261)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rMisbeta (1)
Rmisc (1)
Rmpfr (3)
Rmpi (1)
rms (3)
rmsb (1)
rmspc (1)
RMTstat (1)
rmutil (0)
rMVP (1)
RMySQL (4)
RNAi (1)
RNAmodR.Data (1)
RNAseq123 (130)
rnaseq123 (1)
rnaseqDTU (36)
rnaseqdtu (1)
rnaseqGene (152)
rnaseqgene (1)
RnaSeqGeneEdgeRQL (79)
rnaseqgeneedgerql (1)
rnaturalearth (2)
rnaturalearthdata (1)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (2)
rngWELL (1)
rnoaa (1)
RNOmni (1)
roak (0)
robfilter (2)
robust (4)
robustbase (18)
robustlmm (1)
RobustRankAggreg (0)
ROC (1)
ROCit (1)
ROCR (1)
RODBC (2)
ROI (1)
ROI.plugin.glpk (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
roll (1)
rols (0)
Rook (1)
rootSolve (14)
ropls (1)
ROSE (1)
rosm (1)
rotl (2)
roxygen (1)
roxygen2 (74)
rpact (1)
rpart (74)
rpart.plot (1)
rpf (1)
RPMG (1)
RPostgres (12)
RPostgreSQL (2)
rprojroot (135)
RProtoBufLib (1)
rpsftm (1)
rrapply (0)
rrcov (7)
rrcovNA (1)
rredlist (1)
RRPP (1)
rrsq (1)
rsample (14)
Rsamtools (3)
rsatscan (1)
RSclient (1)
rsconnect (55)
RSEIS (1)
RSelenium (1)
Rserve (8)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
rsnps (1)
rsparkling (1)
rsparse (1)
RSpectra (15)
Rspectra (1)
rspm (1)
RSQLite (165)
RsSimulx (0)
rstan (2)
rstanarm (1)
rstanemax (1)
rstantools (2)
rstatix (11)
rstpm2 (1)
rstudioapi (126)
Rsubread (1)
rsvd (3)
rsvg (3)
rtables (3)
rticles (1)
rtkore (1)
rtracklayer (1)
Rtsne (26)
Rttf2pt1 (3)
rtweet (7)
rugarch (2)
RUnit (2)
runjags (1)
Runuran (0)
ruODK (1)
RUVseq (0)
RVAideMemoire (1)
Rvcg (1)
rvcheck (3)
rversions (9)
rvertnet (1)
rvest (66)
rvg (1)
Rvmmin (1)
Rwave (0)
rworldmap (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)
s2 (48)
S4Arrays (2)
S4Vectors (11)
S4vectors (1)
saemix (1)
safeBinaryRegression (1)
SAGx (1)
SAIGEgds (1)
sampling (1)
sandwich (10)
santoku (1)
sas7bdat (1)
sasLM (1)
sass (236)
sassy (1)
SASxport (1)
satchel (1)
satellite (1)
SBGNview.data (0)
ScaledMatrix (1)
scales (118)
scam (0)
scater (1)
scatterD3 (1)
scattermore (23)
scatterpie (23)
scatterplot3d (27)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (2)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
ScDblFinder (1)
scDblFinder (1)
sceptre (1)
scGate (1)
scico (1)
scidb (1)
scITD (1)
scLinear (0)
scMerge (1)
SCP (1)
scPipe (0)
scran (1)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (0)
scrypt (4)
scs (1)
SCtools (1)
sctransform (26)
sctrnasform (1)
scuttle (1)
scviewer (1)
sda (1)
sdmpredictors (1)
SDMTools (1)
sdpR (1)
sdtmchecks (1)
secretbase (1)
secrets (1)
see (1)
segmented (13)
selectr (1)
sen2r (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SeqArray (1)
seqinr (5)
seqLogo (1)
seqmagick (3)
seqminer (1)
seqpac (22)
sequencing (28)
sequenza (1)
seriation (17)
SeruatObject (1)
servr (4)
sesame (1)
sesameData (1)
sessioninfo (4)
set6 (1)
setRNG (1)
sets (1)
Seurat (40)
seurat (1)
SeuratData (1)
SeuratDisk (1)
SeuratObject (32)
SeuratWrapper (1)
SeuratWrappers (1)
sf (51)
sfheaders (17)
sfsmisc (3)
shadowtext (21)
shape (35)
shapr (0)
shinipsum (1)
shiny (218)
shiny.blueprint (0)
shiny.fluent (1)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shiny.semantic (1)
shinyAce (1)
shinyalert (3)
shinyauth (1)
shinyBS (4)
shinybusy (12)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (3)
shinydashboardPlus (4)
shinydisconnect (1)
shinyFeedback (1)
shinyFiles (3)
shinyglide (0)
ShinyItemAnalysis (18)
shinyjqui (1)
shinyjs (6)
shinyLP (2)
shinymanager (2)
shinyMethyl (1)
shinyMobile (1)
shinyscreenshot (4)
shinySelect (0)
shinystan (1)
shinytest (1)
shinytest2 (7)
shinythemes (2)
shinytoastr (1)
shinyTree (3)
Shinyusagelogr (1)
shinyvalidate (53)
shinyWidgets (81)
ShortRead (1)
showtext (2)
SIAMCAT (1)
SID (1)
sigclust (1)
Sigfried (1)
Signac (3)
signal (1)
SimDesign (1)
SimInf (1)
simpar (1)
simpleSingleCell (39)
simplesinglecell (1)
simr (1)
simresults (1)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellExperiment (2)
singleCellTK (1)
SingleR (1)
SingscoreAMLMutations (20)
singscoreamlmutations (1)
sirnakit (1)
siscreener (1)
sitmo (8)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SkewHyperbolic (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (0)
slam (1)
slickR (0)
slider (12)
slingshot (1)
slopeR (1)
sm (1)
smacof (1)
SmartEDA (1)
sme (1)
smldesign (1)
smooth (1)
smoother (1)
smoothHR (0)
SMVar (2)
sn (2)
sna (2)
snakecase (21)
snapcount (1)
snow (17)
SnowballC (3)
snowfall (1)
snpar (1)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (0)
sodium (11)
solrium (1)
SomaDataIO (1)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
sortable (6)
sos (1)
SoupX (1)
sourcetools (47)
sp (98)
spacetime (1)
spacrt (1)
spam (5)
spaMM (1)
sparklyr (1)
SPARQL (1)
SparseArray (1)
sparsebn (1)
SparseM (5)
sparseMatrixStats (1)
sparsesvd (2)
spatial (48)
SpatialDecon (1)
SpatialEpi (1)
spatialreg (1)
spatstat (3)
spatstat.core (15)
spatstat.data (28)
spatstat.explore (23)
spatstat.geom (37)
spatstat.linnet (2)
spatstat.model (2)
spatstat.random (24)
spatstat.sparse (29)
spatstat.utils (28)
spatsurv (1)
spData (17)
spdata (1)
spdep (9)
spectacles (1)
speedglm (1)
spelling (3)
spgs (1)
spicyworkflow (1)
spicyWorkflow (14)
SpidermiR (1)
splancs (1)
SplicingVizUtils (1)
splines2 (1)
splitTools (1)
splus2R (2)
spocc (1)
SPOTlight (1)
spsComps (1)
SQUAREM (1)
SSDM (1)
ssh (1)
StanHeaders (3)
stargazer (1)
stars (3)
starter (1)
startup (5)
StatCharrms (1)
statmod (15)
statnet (1)
statnet.common (2)
statsExpressions (2)
statTarget (1)
stdmchecks (1)
stevedore (1)
stinepack (1)
stopwords (1)
storr (1)
strandannotate (0)
strex (2)
string (1)
stringdist (11)
stringfish (9)
stringi (229)
stringr (187)
striprtf (1)
strucchange (1)
structToolbox (1)
styler (57)
subselect (1)
SummarizedExperiment (2)
summarytools (1)
sunburstR (0)
SuperLearner (1)
SuppDists (1)
survcomp (1)
survex (1)
survey (2)
survival (156)
survivalROC (1)
survminer (2)
survMisc (2)
survMS (1)
sva (1)
svd (1)
svglite (20)
svMisc (0)
svUnit (1)
swamp (1)
Swiffer (1)
symengine (1)
symphony (2)
synapser (1)
synbreed (1)
Synth (1)
sys (144)
sysfonts (1)
systemfit (0)
systemfonts (178)
syuzhet (1)
table1 (2)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
tabulizer (1)
tabulizerjars (1)
tarchetypes (7)
targets (7)
TauStar (1)
taxize (1)
taxonomizr (1)
TCC (6)
TCGAbiolinks (1)
TCGAWorkflow (58)
tcgaworkflow (1)
tclust (1)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.builder.modules (1)
teal.code (1)
teal.data (1)
teal.logger (1)
teal.modules.clinical (1)
teal.modules.general (1)
teal.modules.sanofi (1)
teal.osprey (1)
teal.reporter (1)
teal.slice (1)
teal.widgets (1)
templater (1)
tensor (1)
tensorA (2)
tensorflow (10)
tergm (1)
tern (1)
tern.gee (1)
tern.mmrm (1)
terra (49)
tesseract (1)
tester (1)
testit (1)
testproj (0)
testthat (208)
texreg (2)
text2vec (1)
textfeatures (1)
textrecipes (1)
textshaping (72)
TFBSTools (1)
TFisher (1)
TFMPvalue (1)
tfruns (5)
tfse (1)
tgp (1)
TH.data (48)
thematic (5)
themeSanofi (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
ThresholdROC (1)
tibbke (1)
tibble (102)
tictoc (11)
tidybayes (1)
tidycensus (26)
tidyclust (1)
tidydr (1)
tidygraph (31)
tidyHeatmap (1)
tidylog (0)
tidymodels (4)
tidyposterior (1)
tidypredict (1)
tidyproteomics (1)
tidyquant (1)
tidyr (145)
tidyselect (100)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySummarizedExperiment (1)
tidyterra (1)
tidytext (3)
tidytlg (1)
tidytree (43)
tidyTree (1)
tidyverse (9)
tidyvpc (1)
tidyxl (1)
tiff (3)
tigris (26)
tikzDevice (1)
timechange (93)
timeDate (23)
TimeProjection (1)
timereg (1)
timeSeries (6)
timetk (2)
tinytest (1)
tinytex (264)
tldrm (1)
tm (2)
tmap (1)
TMB (33)
tmle (1)
tmvtnorm (2)
TNO (1)
TNRS (0)
TOAST (1)
tokenizers (3)
tokupika (1)
toOrdinal (1)
topGO (1)
topicmodels (1)
torch (1)
tornado (1)
Tplyr (1)
tracee (1)
trackViewer (1)
tradeSeq (1)
traits (1)
TrajectoryUtils (1)
transformr (0)
transport (1)
treeio (1)
treemap (2)
treemapify (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1)
triebeard (4)
truncnorm (4)
TSCAN (1)
tseries (5)
tsfeatures (3)
tsibble (1)
tsibbledata (1)
tsne (1)
tsoutliers (1)
TSP (17)
ttdo (0)
TTR (5)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (3)
tuneRanger (1)
twang (1)
tweenr (21)
twilight (0)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (1)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (0)
tximeta (1)
tximport (1)
tximportDat (1)
tximportData (1)
txtq (1)
tzdb (75)
uatools (1)
UCell (1)
uchardet (1)
ucminf (2)
udunits2 (1)
ufs (1)
umap (2)
Unicode (1)
UniprotR (1)
units (53)
unmarked (1)
UpSetR (1)
urca (2)
urlchecker (1)
urltools (1)
usdm (1)
useful (1)
usethis (68)
usmap (1)
usmapdata (1)
utf8 (215)
utilsRmd (1)
utilsStuff (1)
uuid (147)
uwot (41)
V8 (27)
validate (1)
valr (1)
VAM (0)
variancePartition (1)
VariantAnnotation (1)
variants (27)
VariantWarehouseBMS (1)
vars (1)
vaultr (1)
vcd (3)
vcfR (1)
vcr (1)
vctrs (302)
vdbR (1)
vdiffr (2)
vegan (6)
vegawidget (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (1)
VennDiagram (1)
VGAM (4)
VGAMextra (1)
vhydeg (0)
VIM (1)
vioplot (1)
vip (1)
vipor (14)
viridis (152)
viridisLite (123)
viridislite (0)
visdat (1)
visNetwork (4)
visR (1)
vistime (30)
vitae (1)
vroom (160)
vsn (1)
waffle (1)
waiter (4)
waldo (147)
wallace (1)
warp (5)
wdman (1)
webchem (1)
webdriver (0)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (0)
webp (1)
webshot (26)
webshot2 (2)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (3)
wesanderson (1)
WGCNA (4)
wheatmap (1)
whereami (0)
whisker (23)
WikidataR (1)
WikipediR (2)
wikitaxa (1)
winboxr (1)
withr (221)
wk (52)
wkb (1)
workflowr (1)
workflows (2)
workflowsets (2)
WorldFlora (1)
worrms (1)
wrapr (1)
Wrench (1)
writexl (10)
WriteXLS (2)
wrMisc (1)
WRS2 (1)
xaringan (1)
xaringanthemer (0)
xcms (1)
xfun (290)
xgboost (61)
xgxr (0)
XIFF (1)
XLConnect (1)
XLConnectJars (1)
xlsx (1)
XML (121)
xml2 (168)
xopen (8)
xpose (1)
xslt (0)
xtable (1)
xts (15)
XVector (1)
yaImpute (1)
yaml (133)
yardstick (7)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (43)
zCompositions (2)
zelusutils (1)
zen4R (1)
zenith (1)
zinbwave (1)
zip (120)
Ziploc (1)
zlibbioc (2)
zoo (34)